MATLAB生物化工计算与模拟

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适读人群 :本书适合生物化工及相关领域MATLAB的初、中级读者,可供高等院校生物工程、化学工程、环境工程、制药工程、食品工程及相关专业师生阅读参考,也可供相关领域科研人员自学与参考。

全书从解决生物工程及相关领域的实际问题出发,通过近百个典型案例,介绍了MATLAB在生物工程方面的应用方法与技巧。

内容简介

MATLAB作为一款高性能数值计算软件,以其易学易用功能为生物化工领域解决数值计算问题提供了便捷的解决方案。本书从解决生物化工及相关领域的实际问题出发,以MATLAB R2016b版本为平台,通过近百个实例,详尽介绍了用MATLAB实现酶反应、微生物反应、化工传热及传质过程的数据分析与统计、参数计算与优化、动力学模拟、模型参数估计的方法与技巧。全书内容包括MATLAB入门基础、线性与非线性方程(组)求解、符号微分与积分、数值微分与积分、数据插值与拟合、无约束与有约束的线性及非线性规划等内容。涵盖了MATLAB符号运算工具箱、曲线拟合工具箱、优化工具箱、统计工具箱、生物过程模拟工具的应用。

本书适合生物化工及相关领域MATLAB的初、中级读者,可供高等院校生物工程、化学工程、环境工程、制药工程、食品工程及相关专业师生阅读参考,也可供相关领域科研人员自学与参考。

章节目录

第1章 MATLAB基础 / 001

1.1 MATLAB工作环境 / 001

1.1.1 MATLAB窗口 / 001

1.1.2 M文件的编辑调试环境 / 003

1.1.3 在线帮助 / 005

1.2 数学运算 / 006

1.2.1 基础运算 / 007

1.2.2 数组及运算 / 008

1.3 绘图功能 / 012

1.3.1 基本图形 / 012

1.3.2 对数坐标图形 / 019

1.3.3 函数绘图 / 019

1.3.4 双轴绘图 / 020

1.4 数据导入与导出 / 021

1.4.1 数据导入 / 021

1.4.2 数据导出 / 025

第2章 线性与非线性方程(组)的应用 / 027

2.1 线性方程组 / 027

2.1.1 细胞反应的元素衡算 / 028

2.1.2 细菌共存数的确定 / 028

2.1.3 多级逆流萃取理论级数的确定 / 029

2.2 非线性方程(组) / 032

2.2.1 应用基础 / 032

2.2.2 汽液平衡组成及泡点温度的确定 / 036

2.2.3 分批培养过程细胞浓度的确定 / 037

2.2.4 换热器组温度的优化 / 038

2.2.5 传热过程流量的调节 / 040

第3章 微分模型的应用 / 042

3.1 微分的解析解 / 042

3.1.1 微分方程与微分函数的解析解 / 042

3.1.2 连续搅拌反应器最大稀释率的确定 / 045

3.1.3 酶底物抑制动力学方程及最佳底物浓度的确定 / 047

3.1.4 发酵培养基最佳配方的确定 / 048

3.2 微分方程数值解 / 050

3.2.1 应用基础 / 050

3.2.2 细胞生长动力学模拟 / 051

3.2.3 细胞分批培养过程动力学模拟 / 052

3.2.4 有/菌体死亡的细胞生长与基质消耗的动力学模拟 / 054

3.2.5 恒速流加细胞分批培养过程的动态模拟 / 060

第4章 积分模型的应用 / 064

4.1 符号积分 / 064

4.1.1 应用基础 / 064

4.1.2 均相酶促反应时间的确定 / 066

4.2 数值积分 / 067

4.2.1 应用基础 / 067

4.2.2 均相酶促反应时间的确定 / 069

4.2.3 乳糖在平推流反应器中水解的A/F的确定 / 069

4.2.4 高浓度气体吸收传质单元数的计算 / 070

第5章 数据插值与拟合 / 073

5.1 数据插值 / 073

5.1.1 一维与二维插值 / 073

5.1.2 折光率与乙醇质量分数的估算 / 076

5.1.3 发酵时间与青霉素浓度的估算 / 077

5.2 数据拟合——曲线拟合工具箱(Curve Fitting Toolbox)的应用 / 079

5.2.1 Curve Fitting Toolbox的交互环境 / 079

5.2.2 多项式拟合——反应物分压与反应时间关系模型 / 080

5.2.3 有理式拟合——抑制的细胞生长动力学模型 / 081

5.2.4 幂函数拟合——强制对流传热关联式及反应级数的确定 / 082

5.2.5 自定义方程拟合——有/抑制剂的酶反应动力学模型 / 088

第6章 优化工具箱(Optimization Toolbox)的应用 / 093

6.1 线性规划 / 093

6.1.1 约束与有约束线性规划 / 093

6.1.2 污水系统处理费用最小值的确定 / 096

6.2 非线性规划 / 097

6.2.1 约束与有约束非线性规划 / 097

6.2.2 保温层厚度的优化 / 100

6.2.3 发酵生产年利润最大化的确定 / 103

6.3 优化工具箱图形用户界面(GUI) / 105

6.3.1 GUI优化工具的启动与使用 / 105

6.3.2 约束优化(fminunc/ fminsearch求解器) / 106

6.3.3 有约束优化(fmincon求解器) / 107

6.3.4 线性规划(linprog求解器) / 108

6.3.5 非线性最小二乘优化(lsqnonlin求解器) / 108

6.3.6 遗传算法优化(ga求解器) / 108

6.3.7 遗传算法优化发酵过程体积溶氧传递系数(ga求解器) / 110

第7章 细胞反应动力学模型参数的估计 / 114

7.1 细胞反应动力学研究方法 / 114

7.2 洋葱伯克霍尔德菌分批发酵动力学研究 / 114

7.2.1 模型建立与模型参数估计方法 / 115

7.2.2 模型参数初始值的估计 / 116

7.2.3 动力学模型参数的估计 / 120

第8章 生物系统模拟工具(SimBiology)的应用 / 123

8.1 酶反应动力学模拟 / 123

8.1.1 可逆酶反应动力学模拟 / 123

8.1.2 有抑制剂的酶反应动力学模拟 / 126

8.2 细胞反应动力学模拟 / 129

8.3 细胞反应模型参数的估计 / 132

参考文献 / 136

MATLAB生物化工计算与模拟是2018年由化学工业出版社出版,作者刘俏。

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