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本书从内容范围和结构体系上打破了大多数"生物信息学"书籍以序列分析为主体的模式,注重包含与医学、功能基因组相关的现代医学生物信息学方法及该研究领域的最新研究成果,结构体系注重生物信息学理论方法对医学研究的可实现性与可操作性。
内容简介
《生物信息学理论与医学实践》不仅对生物信息学研究领域的基础知识及基本理论进行了详细介绍,如网络数据资源、序列比对、分子进化、基因芯片及蛋白质结构等;而且介绍了目前国内外生命科学研究应用的热门技术及热点领域,如新一代测序技术、富集分析技术、表观遗传学分析技术、microRNA与疾病研究及药物靶点筛查技术,并对书中涉及的各种分析技术给出详细的应用实例。
作者简介
编者李霞
章节目录
版权信息
序言
绪论
第一节 生物信息学的产生及发展
第二节 生物信息学的主要研究内容
第三节 当前生物信息学研究的热点
第一章 序列比对与序列特征分析
第一节 获取DNA、RNA和蛋白质序列
第二节 双序列比对
第三节 多序列比对
第四节 核酸序列特征分析
第五节 蛋白质序列特征分析
第六节 应用实例
参考文献
第二章 基因芯片数据分析
第一节 基因芯片平台简介
第二节 基因芯片数据的预处理
第三节 特征基因挖掘
第四节 基因芯片数据的聚类分析
第五节 基因芯片数据的分类分析
第六节 基因芯片数据库及常用分析软件
参考文献
第三章 基因注释与功能分类
第一节 引言
第二节 基因注释数据库
第三节 基因功能预测
第四节 基因集合富集分析
第五节 基因功能比较
参考文献
第四章 蛋白质结构分析
第一节 蛋白质高级结构
第二节 蛋白质的结构解析与预测
第三节 蛋白质高级结构预测方法
第四节 基于蛋白质结构的功能分析
第五节 蛋白质的结构异常与疾病
第六节 应用实例
参考文献
第五章 分子进化分析
第一节 系统发生分析与重建
第二节 核苷酸和蛋白质的适应性进化
第三节 分子进化与生物信息学
第四节 应用实例:SARS流行病的系统发生分析
参考文献
第六章 新一代测序数据分析
第一节 全基因组测序与重测序
第二节 新一代测序技术和工作流程
第三节 新一代测序数据存储、处理与分析
第四节 DNA和RNA测序
第五节 研究实例:基于新一代测序技术的癌症组学研究
参考文献
第七章 转录调控的信息学分析
第一节 基因的转录调控
第二节 启动子的信息学分析
第三节 转录因子结合位点的信息学研究
第四节 可变剪接的生物信息学研究
第五节 转录调控与人类疾病
第六节 应用实例
参考文献
第八章 生物分子网络与通路
第一节 网络的基本概念
第二节 生物分子网络种类
第三节 生物分子网络分析方法
第四节 通路的网络分析方法
第五节 应用实例:疾病代谢子通路识别、网络构建和分析
参考文献
第九章 复杂疾病的系统遗传学分析
第一节 复杂疾病的分子遗传学特征
第二节 变异组信息学与复杂疾病遗传定位
第三节 复杂疾病的分子系统分析
第四节 系统遗传学集成软件工具
参考文献
第十章 miRNA与复杂疾病
第一节 miRNA与其靶基因
第二节 miRNA转录组
第三节 miRNA调控网络
第四节 miRNA多态和复杂疾病
参考文献
第十一章 计算表观遗传学
第一节 引言
第二节 表观基因组图谱绘制
第三节 表观遗传修饰谱分析
第四节 表观遗传异常标记物识别
第五节 人类表观基因组计划及意义
第六节 应用实例:用于疾病的风险预测、诊断、预后及治疗的表观基因组数据分析
参考文献
第十二章 药物生物信息学
第一节 药学相关信息资源
第二节 基于生物信息学方法发现潜在药物靶标
第三节 药物基因组学
参考文献
生物信息学理论与医学实践是2013年由人民卫生出版社出版,作者李霞 主编。
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